In Metal Gear Solid geht es um Solid Snake, einen Soldaten, der in eine Atomwaffenanlage eindringt, um die terroristische Bedrohung durch FOXHOUND, eine abtrünnige Spezialeinheit, zu neutralisieren. Snake muss zwei Geiseln befreien, den Chef der DARPA und den Präsidenten eines großen Waffenherstellers, die Terroristen konfrontieren und sie davon abhalten, einen Atomschlag zu starten.